工程罚款应计入“营业外支出--罚款支出”科目。

营业外支出是指企业在生产经营期间，固定资产清理所发生的损失，借记“营业外支出”科目（处置固定资产净损失），贷记“固定资产清理”科目。企业在清查财产过程中，查明固定资产盘亏，借记“营业外支出”科目(固定资产盘亏)，贷记“待处理财产损益——待处理固定资产损溢”科目。

记入“长期待摊费用”。如果是行政性罚款（交通处罚等）的，下次结转管理费用时后，在计算企业所得时，需要作纳税调整征收企业所得税。