超二级结构不属于二级结构。

二级结构指蛋白质分子某一段肽链的局部空间结构，就是该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构像，主要的形式有α-螺旋，β-折叠，β-转角和Ω-环。

超二级结构指在许多蛋白质分子中，可由2个或2个以上具有二级结构的肽段在空间上相互接近，形成一个有规则的二级结构组合，称为超二级结构……经研究发现，α-螺旋之间、β-折叠之间以及α-螺旋与β-折叠之间的相互作用，主要是由非极性氨基酸残基参与的。