根据《财政部、国家税务总局关于营业税改征增值税试点的通知》（财税[2016]36号）附件2第一条第（十三）项第二款规定，试点纳税人发生应税行为，在纳入营改增试点之日前已缴纳营业税，营改增试点后因发生退款减除营业额的，应当向原主管地税机关申请退还已缴纳的营业税。

因此，房地产开发公司因购房人退房而发生退款减除营业额的，可以向原主管地税机关申请退还已缴纳的营业税。