在处理工程招标串标时，可以采取以下措施：

1. 取消串标投标人的投标资格，不予考虑其投标文件；

2 对串标投标人进行处罚，例如罚款、暂停参与招标等；

3.招标人进行处罚，例如取消其招标资格、罚款等；

4 向相关部门举报串标行为，追究法律责任在处理工程招标串标时，当严格按照招标规则和相关法律规进行处理，保障公平竞争和诚信投标的原则。

发现有串标，收到投标单位标书中剔除串标单位后评标，同时没收串标单位投标保证金，列入黑名单，不允许一年内再参与其他项目招标。

处中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款，对直接责任人员处单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款。

有违法所得的没收违法所得，情节严重的取消其一年至二年内的投标资格，由工商行政管理机关吊销营业执照，构成犯罪的依法追究刑事责任。