大部分水利系统不属于垂直单位。

大部分情况是，中央，省、市、县水利部门都是本级政府的职能部门，为辖区内的水行政主管部门，统一管理辖区内的水利事务。

而水利系统垂直单位分为两种，一种是省水利厅以下垂直（水文分局或水位站，考虑到防汛抗旱将水文部门省以下垂直）；一种是水利部以下垂直（流域机构，便于处理、管理省级边界工程）。