安徽工程大学王牌专业是：国家级特色专业：机械设计制造及其自动化，自动化，艺术设计；国家级专业综合改革试点专业：自动化；省级重点学科：检测技术与自动化装置，设计艺术学，纺织工程，管理科学与工程，机械设计制造及其自动化，发酵工程。