上海海洋大学博士学位授权点分别是：

水产、海洋科学、生物学、食品科学与工程

据学校官网显示，上海海洋大学拥有3个博士后科研流动站、4个一级学科博士学位授权点、13个一级学科硕士学位授权点、1个二级学科硕士学位授权点、7个硕士专业学位授权点、39个本科专业及方向。拥有1个国家“双一流”建设学科、1个国家重点学科、3个上海高校高峰高原学科、3个上海高校一流学科、9个省部级重点学科。

2个学科进入ESI全球排名前1%。