酸性染料和碱性染料的染色作用常是对立的，而不是一致的。任何染料均可电离，离解出阳离子或阴离子。

酸性染料中的酸性部分有染色作用的是阴离子；碱性染料中的碱性部分有染色作用的是阳离子，细胞内同时含有酸性和碱性物质，酸性物质与碱性染料中的阳离子相结合，如细胞核（含有核酸）黏液和软骨基质呈酸性部分被盐基性染料苏木素所染、反之碱性物质与酸性染料的阴离子相结合，如细胞浆及其内部的某些颗粒物质被酸性染料伊红所染。

染料的颜色基不是在阳离子，就是在阴离子上，这些离子将因组织反应不同而发生化学结合，如显示含铁血黄素的普鲁士兰反应是最典型的例子。但是，大量染色的化学反应并不象铁反应那样明确，实际情况远为复杂。

这是因为蛋白质分子是个分子量自几万至几百万的大分子，每个分子中含有很多阳离子和阴离子基因，在等电点时能形成游离的两性离子

衣服染色涉及到的化学反应主要是染料与纤维之间的相互作用。染料分子中的色团与纤维表面的官能团发生化学键的形成，如氢键、离子键或共价键。

这些键的形成使染料分子牢固地附着在纤维上，实现染色效果。

此外，染色过程中还可能涉及溶解、扩散、吸附等化学过程，以及酸碱调节、氧化还原等反应来调控染色效果。

这些化学反应共同作用，使得染料能够均匀地渗透到纤维内部，实现衣物的染色。

衣服染色涉及到的化学反应主要有氧化-还原反应、收缩反应、交联反应和合成反应。

氧化-还原反应是一种化学反应，它涉及染料分子的氧化物与氮原子的还原而生成不同颜色的染料分子。

收缩反应涉及染料分子因水分析而产生收缩，以达到用光来显示出不同的的色彩。

交联反应通过将两种不同染料分子的键结接合在一起，并且牢固地黏在衣服的纤维上，以便衣服能保留彩色多长时间。

合成反应是利用合成有机染料分子，把他们结合在一起，最终形成特定染料，可以提供专门的色调。