小檗碱又称黄连素，广泛分布在植物界，大约有4个科10个属植物都已发现有小檗碱存在。

小檗碱可从三颗针、黄连、黄柏等植物中提取。由于黄连生长缓慢，价格较高，黄柏来源也较少，现我国主要应用三颗针作为提取原料。

三颗针，中药名。为小檗科植物刺黑珠、毛叶小檗、细叶小檗、匙叶小檗等的根皮或茎皮。

答案是；小檗碱主要存在于黄连、黄柏、三颗针等中草药中。

黄连为毛茛科植物，黄连、三角叶黄连或云连的干燥根茎。黄连是“苦”的代表药，其功效全在“苦”上。

如黄连、黄芩、黄柏中都含有小檗碱。

小檗碱是一种四价生物碱，源于植物的抗菌药物，具有微弱的抑菌作用。但对痢疾杆菌、大肠杆菌引起的肠道感染有效。