云南九大高原湖泊包括抚仙湖、洱海、泸沽湖、阳宗海、滇池、程海、杞麓湖、异龙湖和星云湖，其保护治理是云南生态环境建设的重中之重。

云南九大高原湖泊水质总体保持稳定。其中抚仙湖、泸沽湖水质符合Ⅰ类标准；洱海符合Ⅱ类标准；阳宗海符合Ⅲ类标准；滇池草海符合Ⅳ类标准、外海符合Ⅴ类标准；程海符合Ⅳ类标准；杞麓湖、异龙湖符合Ⅴ类标准；星云湖为劣Ⅴ类。