地理信息系统专业有两个硕士学科：地图学与地理信息系统（070503）,这个是理学的，属于地理学一级学科的；另一个是地图制图学与地理信息工程（081603），这个是工学的，属于测绘类的。

所以你可以选第一个理学的，当然你最好先咨询一下你报考学校确认一下。