同济大学南开大学和武汉大学这三所大学都是在全国比较著名的985大学，知名度都比较高。但仔细比较，这三所大学中，武汉大学在全国大学综合排名较高，一直位列前十位以内，比同济大学和南开大学排名都高，因此，就这三所大学综合比较，武汉大学比其它两所大学要好。

同济大学偏重于理工科，而南开大学、武汉大学为综合性大学，理、工、文史相对均衡。三所学校属同等档次，不相伯仲。