南京工程学院交通运输专业的主要研究方向包括交通规划、交通工程、交通安全、交通环境及交通智能管控等。

学生需要学习交通运输的基本理论和方法，掌握交通运输市场调研、规划设计和运营管理等方面的技能。

该专业毕业生可以在道路交通、轨道交通、水路交通、航空运输等交通运输领域从事规划、设计、运营、管理和咨询等工作。