中南林业科技大学和湖南农业大学都是湖南省属的一流本科高校，各有其独特的优势。湖南农业大学在师资力量、学科建设以及一些硬件设施如优势平台建设、一级博士点硕士点数等方面较中南林业科技大学占优。然而，中南林业科技大学的位置优越，位于市中心，为学生提供了便利的生活条件。

另一方面，两所学校在农林类学科以外的发展也有所不同。湖南农业大学在农学门类有深厚的积累，适合对农学感兴趣的学生深造；而中南林业科技大学则在工学和管理学等学科门类的发展上更加偏重。此外，中南林业科技大学在生源质量和国家一流本科专业建设点数量上也有一定的优势。