企业之间的对账函加盖公章或加盖财务专用章都可以。两种印章都具有同等法律效力。

财务专用章用于单位或集团内内部的现金、银行收付业务（内部借款、往来结算）；单位对外的现金、银行收付业务（预留银行印鉴、支票、汇票、业务委托书等）、以及其他外部业务（如工商部门备案等用途）等。