重庆教师资格由教委发放的原因在于教委是负责教育行政管理的政府机构，它负责组织实施教师资格的认定工作。根据《教师资格条例》及其实施办法，教师资格的认定是由教育行政部门来负责的。因此，重庆市教育委员会作为当地的教育行政部门，承担起了颁发教师资格证书的职责。