拼多多商家取消关联店铺可按下面步骤操作：

1.点击关联店铺 ，在拼多多商家后台“快递助手”中,点击“实用工具-关联店铺”。

2.点击取消关联 在店铺名右边,点击取消关联。

3.点击确定 在弹框中,点击确定即可。