可以，付款申请可以作为付款凭证，付款申请但是自制原始凭证，经审核和审批的付款申请但可以作为预付款，支付应付账款的的凭证。

对一些工程项目，按合同和工程进度支付预付款项，可以暂时不开发票，用付款申请单作为付款依据。

同时对一些应付账款，发票已收到并且入入账，但款项未全部支付，也可以用付款申请单。

不可以，申请单是申请而不是最终的付款，只有付款成功才能作为付款凭证