特岗教师三年后入编可以调回原籍的。根据特岗教师规定：在聘任期内，特设岗位教师的户口可根据本人意愿，可留在原籍，也可以迁往受聘市县;档案关系统一转至任教学校所在地的市县教育行政部门。