理论上，丙酮酸进入三羧酸循环氧化脱羧产生乙酰辅酶A,如果肝脏中乙酰辅酶A生成量过多，则会形成乙酰乙酰辅酶A而进入酮体代谢，生成酮体（包含少量的丙酮）。

实际上，酮体的主要来源是：禁食或糖尿病状态下，肝脏因脂肪动员降解而产生的过多的乙酰辅酶A。丙酮酸形成的乙酰辅酶A是脂肪酸合成的基本原料。

此外，丙酮酸进入三羧酸循环后可产生系列中间物，这些中间物很多可以合成生酮氨基酸或兼性氨基酸。这些氨基酸在碳骨架降解时，也可以产生酮体。