往来互转对账时，首先将两方账簿上的往来科目余额进行核对，确认余额是否一致。若余额一致，则表示往来账目准确。若不一致，则需要详细核对交易明细，找出差异所在。差异解决后，双方账簿上的往来科目余额应一致。此外，还需核对账上余额与实际资金余额是否相符，以确保对账的真实性。