在单位会计和出纳关系一般不好的原因是，1、根据工作关系决定的。

因为根据国家会计法和会计核算中会计人员相互监督的规定，一个单位会计和出纳其工作性质是相关独立和相关监督的；

2、工作性质的关系。虽然说会计和出纳工作是相互独立的，但他们的工作又是相关监督和被监督的关系，所以说在日常工作中，因为工作关系就会有摩擦的。

因为会计工作需要经常管出纳，出纳心里不平衡。

会计和出纳关系都不好，这是一个工作中有矛盾，因为会计负责核算而且会计核算都是按权责发生制，但出纳负责收入和支出，这必须是实现制的，这就和权责发生制存在一定差异，有时支出了未必核算，核算了未必支出，这就产生矛盾，不过协调解决是可以的。