差别较大。

因为广州事业单位和公务员虽然都属于公共部门，但是招聘机制、工资待遇、福利保障等方面存在差别。例如，事业单位的招聘考试难度相对公务员要低一些；工资待遇方面，事业单位的岗位工资比公务员略高，但是公务员有较好的绩效考核机制；福利保障方面，两者的待遇也略有不同，如公务员在退休时可以按照工龄算出对应的养老金，而事业单位则较少。

广州事业单位和公务员单位相比在待遇上相差不大，事业单位人员收入比公务员要少一些，但幅度不大。两者最主要的差别是公务员晋升空间和机会比较多，而事业单位相对来说职业天花板比较低，所从事的工作技术性、事务性工作较多。