南充市是四川省高等教育排名第二的教育强市。

境内有西南石油大学，西华师范大学，川北医学院，南充职业技术学院等高校。其中西南石油大学是一本院校，该校的油气勘探专业是国内一类学科，也是享誉国内外的顶级学科。西华师范大学是省内一流师范大学，也是一所综合性大学，其中生物学驰名中外。川北医学院在省内排名第三，其影像学蜚声全国。