总分公司在会计核算上主要有两种模式：

非独立核算

分公司不设置会计账套，不独立编制会计报表。

分公司发生的所有经济业务纳入总公司的会计账套进行核算。

相关凭证传递给总公司，由总公司记账并编制会计报表。

独立核算

分公司单独设置会计账套，独立编制报表，并单独保管会计档案。

分公司进行独立的会计核算，对于资金和经营成果进行独立核算。

账务处理示例：

分公司向总公司汇款：

分公司：借：其他应收款-A分公司 贷：现金

总公司：借：内行存款-A分公司 贷：其他应付款-A公司

总公司向分公司拨款：

分公司：借：备用金 贷：其他应收款-A分公司

总公司：借：其他应付款-A公司 贷：内行存款-A公司

报表编制：

总分公司一般根据汇总净利润来计算盈余公积。

抵销内部往来和内部交易，如内部商品调拨。

根据抵消后的净利润计算企业所得税，并在分公司就地分摊。

税务处理：

分公司可以登记为小规模纳税人或一般纳税人。

增值税及附加税按一般企业方式申报。

企业所得税可选择独立核算或非独立核算。

选择核算模式时，需考虑分公司的业务类型、管理需求及税务规定。