注销公司时需要缴纳的税种主要包括：

流转税：

根据公司的经营活动和交易情况，可能需要缴纳增值税、消费税等。

企业所得税：

公司如果有盈利，需要按照税法规定缴纳企业所得税。

个人所得税：

如果公司向股东分配剩余资产，股东可能需要缴纳个人所得税。

房屋租赁税：

如果公司使用了租赁房产，可能需要缴纳房屋租赁税。

实收资本印花税：

即使公司的注册资本未完全到位，在注销时仍需补交实收资本印花税。

账本印花税：

公司运营期间使用的账簿可能需要缴纳账本印花税。

其他欠税和罚款：

包括未缴清的各类税款和可能产生的滞纳金、罚款等。

注销公司前，应确保所有税务事项清算完毕，包括补缴税款、缴清罚款等，以便顺利完成注销手续。需要注意的是，具体应缴纳的税种和金额，需要根据公司的实际情况和当地税务机关的规定来确定。