差额纳税的操作步骤通常包括以下几个方面：

确认适用差额征税

确定是否符合差额征税的条件。

计算应纳税额

根据规定计算应纳税额，通常为销售额减去允许扣除的成本费用后的余额乘以适用税率。

准备申报资料

准备财务报表、凭证等相关的纳税资料。

填写纳税申报表

在税务申报系统中填写销售额、成本额、利润额等相关数据，并注明差额征税的相关信息。

提交申报材料

将填写好的纳税申报表提交给税务机关。

缴纳应纳税款

根据计算出的应纳税额，在规定的时间内向税务机关缴纳相应的税款。

保存凭证