工程计提折旧的处理方法如下：

1. 当企业自行建造固定资产时，所使用的固定资产计提的折旧应计入在建工程成本。

会计分录为：

```

借：在建工程

贷：累计折旧

```

2. 如果固定资产已经转为固定资产，则其计提的折旧应计入相应的成本或费用科目，如管理费用、销售费用、制造费用等。

会计分录为：

```

借：管理费用/销售费用/制造费用——折旧费

贷：累计折旧

```

3. 对于经营租出的固定资产，其应提的折旧额应计入其他业务成本。

会计分录为：

```

借：其他业务成本

贷：累计折旧

```

4. 计提折旧时需要注意，当月增加的固定资产，当月不计提折旧，从下月起计提折旧；当月减少的固定资产，当月仍计提折旧，从下月起不计提折旧。

5. 固定资产提足折旧后，不论能否继续使用，均不再计提折旧；提前报废的固定资产，也不再补提折旧。

以上是工程计提折旧的基本处理方法。需要注意的是，折旧方法的选择应基于与固定资产有关的经济利益的预期实现方式，常用的折旧方法包括年限平均法、工作量法、双倍余额递减法和年数总和法等