长途客运纳税应遵循以下步骤：

税务登记：

长途客运企业首先需要注册税务登记，并取得税务登记证。

增值税：

长途客运属于交通运输业，适用6%的增值税税率。企业在购进货物或服务时可以抵扣进项税额，并开具增值税专用发票。

其他税费：

除了增值税，长途客运企业还需缴纳城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加等税费。

纳税期限：

纳税期限为每月15日前，企业需通过电子税务局或到税务局办理申报和缴税手续。

发票和凭证：

企业应保留相关发票和凭证，以备税务机关查验。

社会保险费：

根据《社会保险法》，企业在支付给员工薪酬时，必须向当地的社会保险局缴纳社会保险费。

印花税：

运输合同要按运输收入的万分之三计征印花税。

简易计税方法：

一般纳税人提供的公共交通运输服务可以选择适用简易计税方法计税，征收率为3%。

请根据最新的税法规定和当地政策进行纳税，并确保按时申报和缴纳税款。