土地增值税清算成本主要包括以下几项：

1. 取得土地使用权所支付的金额，包括地价款和相关费用。

2. 房地产开发成本，具体包括：

土地征用及拆迁补偿费，如土地征用费、耕地占用税、劳动力安置费等。

前期工程费，如规划、设计、可行性研究等支出。

建筑安装工程费，无论是出包还是自营方式产生的费用。

基础设施费，如小区内道路、供水、供电等工程的支出。

公共配套设施费，如不能有偿转让的公共配套设施费用。

开发间接费用，如工资、职工福利费、办公费、折旧费等。

以上各项成本在计算土地增值税时，可以按规定比例进行扣除，以确定应纳税额。