过路费发票的认证抵扣流程通常遵循以下步骤：

获取发票 ：确保您拥有有效的增值税专用发票或增值税电子普通发票。

发票认证

对于高速公路通行费，可抵扣进项税额计算公式为：`高速公路通行费可抵扣进项税额 = 高速公路通行费票据上注明的金额 ÷ （1 + 3%） × 3%`。

对于一级、二级公路、桥、闸通行费，可抵扣进项税额计算公式为：`一级、二级公路、桥、闸通行费可抵扣进项税额 = 一级、二级公路、桥、闸通行费票据上注明的金额 ÷ （1 + 5%） × 5%`。

上传发票：

将通行费发票上传至电子发票服务平台。

勾选认证：

在增值税发票管理系统中选择相应的发票类型进行勾选认证。

提交认证：

登录增值税发票管理系统，确认勾选信息无误后，提交认证申请。

自动认证与抵扣：

系统会自动完成认证，并在次月增值税申报期内自动抵扣。

请注意，通行费电子发票的抵扣期限通常为360天，从发票开具之日起计算。确保在规定的期限内完成认证和抵扣流程。