仓储公司在运营过程中需要缴纳的主要税费包括：

增值税

仓储服务一般纳税人税率为6%。

小规模纳税人征收率为3%（2027年12月31日前优惠政策按1%征收率）。

房产税

自营用房按房产余值适用1.2%税率计算缴纳房产税。

出租用房按租金收入适用12%税率计算缴纳房产税。

土地使用税

根据企业使用的土地面积和规定标准计算缴纳。

企业所得税

法定税率为25%，适用于内资和外资企业。

高新技术企业税率为15%。

小型微利企业税率为20%。

非居民企业税率为20%。

其他税费

城建税、教育费附加、地方教育费附加等，具体税率根据地区不同而有所差异。

水利建设基金等地方性税费。

印花税

按仓储费的0.001贴花。

请注意，税法和相关政策可能会有更新和变动，具体情况建议咨询当地税务部门或专业税务顾问以获得最准确的信息