当从员工工资中扣除罚款时，会计分录应如下：

1. 计提工资时：

借：生产成本（生产车间生产工人薪酬）

制造费用（生产车间管理人员薪酬）

管理费用（行政人员薪酬）

销售费用（销售人员薪酬）

研发支出（从事研发活动人员薪酬）

在建工程等（从事工程建设人员薪酬）

合同履约成本

贷：应付职工薪酬——工资

2. 实际发放工资时，如果罚款已经事先确定并从工资中扣除：

借：应付职工薪酬——工资

贷：营业外收入——罚款

如果罚款是在发放工资时另外收取的，则分录为：

借：其他应收款——罚款

贷：应付职工薪酬——工资

实际收到罚款时：

借：银行存款

贷：其他应收款——罚款

请注意，这些分录是基于罚款的性质和来源，以及是否在工资发放时已经确定扣除罚款。如果罚款是员工应承担的费用，则可能会计入管理费用科目。如果罚款是考核罚款等，则可能会计入营业外收入科目。

请根据具体情况选择合适的会计分录。