运输公司的修车费报销流程通常遵循以下步骤：

填写申请：

司机或经办人填写《费用支付申请表》或《报销单》，并详细说明维修的项目、类别、损坏原因及费用预算。

审核批准：

车辆班长或综合管理部专人审核并签字，对于300元以下的修理项目，由车辆班长直接批准；超过300元的项目，需由车辆班长现场验证并签字后，再报总经办或物流部领导批准。

维修过程：

车辆必须送至公司指定的修理厂进行维修，否则费用不予报销。

维修费用：

修理厂根据维修情况开具正规税票，并提供《汽车修理（加工）用料清单》。

财务审核：

财务管理部会计根据《报销单》、发票、《报修单》及维修清单等进行审核，确保票据真实、合法，并符合财务制度规定。

领导审批：

会计审核无误后，将报销单报请分管领导审批。

付款处理：

出纳根据审批后的报销单和发票进行付款。如付现金，则直接根据单据付款；如付支票，则开具支票并经过会计复核及法人章盖章后，由出纳付支票。

记录备查：

收款人在支票备查登记簿中签领支票，并将支票存根粘贴在记账凭证附件上。付款后，出纳在记账凭证附件上盖付讫章。

定期结算：

车辆送到指定修理厂修理的费用原则上每季度结算一次，修理厂在每季度最后一个月25日前与公司统一结算。