企业注销时处理往来款项应遵循以下步骤和原则：

梳理与核查

对所有往来款项进行全面梳理和核查，确保数据的准确性和完整性。

分类处理

应收账款：根据情况采取催收、坏账核销、债务重组等方式处理。

应付账款：根据合同约定和法律法规要求进行支付或协商解决。

税务合规

确保税务处理的合规性，如坏账核销时准备相关证明材料。

具体处理方法

直接转账法：认为应收账款无法收回时，直接将应收账确认为费用。

坏账准备法：按规定计提坏账准备，发生坏账时冲减坏账准备。

应付账款处理：无法支付的应付款项，按规定程序批准后转作营业外支出。

固定资产处理

财务账上处理固定资产，确保账务清晰。