当库存商品发生损坏时，处理流程通常包括以下几个步骤：

确认损坏情况

对损坏的商品进行详细检查，确定损坏程度。

分类处理

轻微损坏：考虑维修后重新上架销售。

严重损坏：无法修复或维修成本过高的商品进行报废处理。

会计处理

根据损坏原因和程度，进行相应的会计分录处理。

如果是管理不善导致的损失，可能涉及待处理财产损溢、管理费用等科目。

如果是自然灾害等不可抗力因素，可能涉及营业外支出等科目。

税务处理

对于因管理不善导致的损失，可能需要做进项税额转出。

自然灾害等不可抗力因素导致的损失，通常不需要做进项税额转出。

内部调查

开case申请调查损坏原因，明确责任归属。

索赔

如果损坏是由于亚马逊仓库的责任，如商品丢失或损坏，可以向亚马逊进行索赔。

记录与报告

记录损坏商品的处理过程和结果，并按规定报告相关部门。

请根据具体情况选择合适的处理方式，并确保遵循相关法规和公司政策。