个体小超市需要缴纳的税种主要包括：

增值税

对于小规模纳税人，如果月销售额未超过10万元（或季度销售额未超过30万元），可以免征增值税。

增值税的征收方式有查账征收和核定征收，查账征收需要建立账务记录，而核定征收则是根据收入核定利润率后缴纳税款。

附加税

包括城市维护建设税、教育费附加和地方教育费附加，可以享受最高减征50%的优惠政策。

个人所得税

个体户的经营所得需要缴纳个人所得税，税率实行5%-35%的超额累进税率。

其他可能的税种

如果个体户从事特定商品（如金银首饰、贵重珠宝）零售，可能还需缴纳消费税。

根据当地税法规定，可能还需缴纳土地使用税或房产税。

请注意，税法规定可能会有更新，因此建议咨询当地税务机关或专业税务顾问以获取最新的税务信息。