马云是多家公司的股东，其中包括但不限于以下几家公司：

1. 阿里巴巴集团：马云曾是阿里巴巴集团的创始人，并持有相当数量的股份，尽管在2020年7月2日，他的持股比例从6.1%下降到了4.8%。

2. 华谊兄弟传媒股份有限公司：马云持有华谊兄弟9978.28万股，占总股本的4.329%，市值高达2.29亿。

3. 云锋控股有限责任公司：马云持有云锋控股的股份。

4. 浙江湖畔创业研学中心：马云担任法定代表人，并在此中心任职。

5. 上海云锋投资管理有限公司：马云关联企业之一，虞锋和马云共同持股。

6. 杭州坤宝投资咨询有限公司：马云担任法定代表人，持有股份。

7. 以岭药业：马云持有以岭药业727.78万股，占总股本的0.44%。

8. 蚂蚁集团：虽然马云在蚂蚁集团的直接持股比例有所变动，但他曾是该集团的重要股东，并曾通过控制相关合伙企业拥有绝对控股权。

9. 其他上市公司：马云还持有恒生电子、华数传媒、光线传媒、石基信息、华润万东等公司的股份。

请注意，上述信息可能随时间而变化，具体持股比例和投资情况应以最新的官方公告或财务报告为准。如果您需要最新的股东信息，请参考相关公司的最新公告或官方文件