五证合一后变更国税的流程主要包括以下几个步骤：

作废或退回空白发票

月底时，将未用完的空白发票作废或退回。

申报、报税、税款入库

次月，完成申报、报税、税款入库。

确认启用18位税号

到国税窗口确认启用18位税号。

办理税务登记号变更

携带相关资料（如营业执照、企业公章等）到国税大厅办理税务登记号变更。

若在国税有申请过发票，需到国税办税服务厅办理变更。

重新考取CA证书

变更后不能再用老税号登录网厅，需要重新考取CA证书。

处理税控设备

若有税控设备，需要确保税控设备与新的税务登记号一致。