农行逾期还款不自动扣款可能由以下原因造成：

账户余额不足：

如果账户余额在扣款日当天晚上21:00之前不足，系统可能无法完成自动扣款。

系统故障：

银行系统可能出现故障，如网络问题或系统升级，导致无法及时扣款。

付款指令错误：

还款账号、金额或付款日期填写错误也可能导致扣款失败。

逾期后的自动扣款机制：

逾期后，银行会在次日及随后的日子继续尝试扣款，直至账户余额足以清偿逾期欠款。

自动扣款设置问题：

如果设置了自动还款但未生效，或者自动扣款被临时撤消，也会导致逾期还款不被自动扣除。

解决时间：

银行处理还款有一定的时间，通常为1-3个工作日，在此期间，还款金额可能未被系统识别和扣除。

如果您希望避免逾期还款，可以设置自动还款功能，确保账户在还款日有足够的余额。若您不希望自动扣款，可以通过农行网上银行或手机银行关闭自动还款服务。