水厂进行大修的会计处理通常遵循以下步骤和原则：

确认大修理费用

包括材料费、人工费、机械租赁费等。

会计分录

当大修理费用达到固定资产原值的50%以上时，可以计入固定资产成本：

贷：在建工程

如果大修理费用未达到原值的50%，则可能计入当期损益，作为修理费用处理：

借：管理费用（或制造费用等）-修理费

贷：银行存款或原材料等

摊销或预提

如果大修理费用较大，收益期超过一年，可以采用费用摊销或费用预提的方法：

摊销：

借：待摊费用

贷：在建工程

预提：

借：相关费用科目（如制造费用）

贷：预提费用

将“在建工程”科目中的大修费用转出，转入“固定资产”科目，并可能需要调整固定资产的折旧方法和期限：

借：固定资产

贷：在建工程

税务处理

如果涉及增值税进项税额，需要相应处理：

借：应交税费——应交增值税（进项税额）

贷：银行存款