施工部门工资通常会计入“在建工程”科目。具体的会计分录如下：

1. 当发放工资时：

借：在建工程

贷：应付职工薪酬-员工工资

贷：应交税金-应交个人所得税等

贷：银行存款/库存现金/其他应付款

2. 当实际发放工资时：

借：应付职工薪酬-员工工资

贷：其他应收款-个人社保费

贷：其他应收款-个人公积金

贷：应交税费-个人所得税

贷：银行存款/库存现金等

施工部门工资是指企业为施工项目支付的直接人工成本，应计入相关资产的成本中。