车船使用费应计入 税金及附加科目。具体会计分录如下：

计算确认时

借：税金及附加—车船使用税

贷：应交税费—应交车船使用税

实际缴纳时

借：应交税费—应交车船使用税

贷：银行存款

期末结转到本年利润

借：本年利润

贷：税金及附加

因此，车船使用费作为企业经营活动中应负担的相关税费，应计入“税金及附加”科目中，以正确反映企业的财务状况和经营成果。