专项基金属于权益类科目，通常用于记录具有特定用途的资金。在会计处理中，专项基金可能根据具体情况记入“专项应付款”或“补贴收入”科目。

当合作社收到国家财政直接补助资金时，会计分录为借记“库存现金”或“银行存款”等科目，贷记“专项应付款”科目。

当合作社使用这些补助资金购置固定资产、农业资产或无形资产时，会计分录为借记相应的资产科目，贷记“库存现金”或“银行存款”等科目，同时借记“专项应付款”科目，贷记“专项基金”科目。

专项基金是由社会团体、事业单位、企业或个人设立的，用于特定目的的资金。