支付保函的会计处理如下：

1. 当企业支付保函保证金时，会计分录为：

借：其他货币资金—保证金存款

贷：银行存款

2. 当企业支付保函手续费时，会计分录为：

借：财务费用—手续费用

贷：银行存款

以上会计分录反映了企业在支付保函时，如何将资金从银行存款转移到其他货币资金账户，以及支付保函手续费时如何将费用计入财务费用科目。