未收到发票但已抵扣的处理：根据国家税务总局规定，未收到增值税专用发票等可抵扣发票前，不得进行抵扣。若已抵扣，后续收到发票则按对应金额和税额等入帐，并将原件贴入对应凭证。若无法收回发票，则需进行进项税转出操作。企业和销售方需协商，由销售方提供发票复印件。摘要字数控制在200字以内。

未收到发票但已抵扣增值税的处理方法

未收到发票的情况下进行抵扣是不合规的。根据国家税务总局的最新公告，对于增值税一般纳税人所取得的特定发票，如增值税专用发票等，取消了认证确认、稽核比对、申报抵扣的期限。纳税人在申报增值税时，需通过本省的综合服务平台对扣税凭证信息进行确认。只有收到可认证抵扣的发票后，方可进行勾选认证等操作。

未收到发票的抵扣处理：

已与供应商协商但未收到发票的情况：

1. 若后续能收到发票，应先与销售方沟通，请求其提供发票复印件。企业可先根据发票复印件的内容，如金额、税额等，进行入账处理。

2. 待企业实际收到发票原件后，再将原件贴入对应的凭证。

无法收回发票的情况：

若确定无法收回发票，则需要进行进项税的转出操作。具体为：在会计分录中，将已抵扣的进项税额从“应交税费-应交增值税（进项税额）”科目转出，确保账务的准确性。

请注意，以上内容均基于国家税务总局的相关规定，企业在处理相关事务时，务必遵循法规要求，确保合规操作。