三个点的发票指的是增值税发票上注明的税率为3%。根据增值税抵扣的规定，一般纳税人收到这样的发票时，可以抵扣的进项税额是发票上税额的3%。具体计算方法是：

抵扣金额 = 不含税金额 × 3%

例如，如果一张发票的开票金额（含税）为103元，那么不含税金额是100元，税额是3元。则可以抵扣的进项税额是：

抵扣金额 = 100元 × 3% = 3元

需要注意的是，抵扣的进项税额只能用于计算应缴纳的销项税，并且抵扣的金额以实际开具的发票金额为准，不能超过该金额。