申请小客车营运资格证需按以下流程进行：

首先，申请人需向住所地或暂住地所在的市道路运输管理机构提交营业性道路客货运输驾驶员从业资格考试的申请。

在提交申请时，需填写完整的《经营性道路客货运输驾驶员从业资格考试申请表》，并准备以下必要文件：身份证明原件及复印件以及机动车驾驶证的原件及复印件。

如果目标是道路客运驾驶员的资格，申请人还需附上道路交通安全主管部门在过去三年内无重大交通事故的证明，以确保符合资格要求。

经过相关审核人员对申请材料的严格审查，若满足条件，将安排相应的考试，这是获取资格证的重要步骤。

最后，通过考试的申请人将获得宝贵的客运资格证，这是从事小客车营运的必备证书。

请注意，以上步骤仅为一般指导，具体情况可能因地区和政策有所不同。对于不确定的环节，强烈建议直接咨询当地的道路运输管理机构获取最准确的信息。