根据查询百度律临网得知，土地增值税如何核定征收土地增值税的征收方式如下：

核定征收，按照转让二手房交易价格全额的1%征收率征收，这种模式类似于目前的个人所得税征收方式。如成交价为50万元,土地增值税应为500000×1%=5000元。

减除法定扣除项目金额后，按四级超率累进税率征收。其中又分两种情况,一是能够提供购房发票，二是不能够提供发票，但能够提供房地产评估机构的评估报告。