有限合伙企业的税收处理遵循特定规则。根据个人所得税法，自然人合伙人执行合伙事务的，其利息、股息、红利等所得按20%的比例税率计算，适用个体工商户生产经营所得的五级超额累进税率，从3%至5%不等。非执行事务的自然人有限合伙人，其股权投资收益同样按照20%的税率缴纳个人所得税。

合伙企业法规定，合伙人违反合伙协议，需依法承担违约责任，包括补缴出资和对其他合伙人可能产生的损失。对于虚假出资和抽逃出资，尽管前者可能被视为未足额缴纳，但抽逃出资是对企业财产权的侵害，违反了合伙企业不得损害企业利益的原则。因此，应在合伙协议中明确禁止并规定违约责任，如有限合伙人违反协议，需承担补缴出资和违约责任。

总结来说，有限合伙企业的税收处理主要依据合伙人身份和合伙协议内容，通过个人所得税和个人责任条款来确保税款的合理缴纳和违规行为的法律责任。在设立和运营过程中，清晰的合伙协议是关键，它将指导税收处理和违约行为的处理方式。